【2026年版】請求書作成サービス比較｜Misoca・マネーフォワード クラウド請求書・freee請求書の選び方

「請求書、いつまで表計算ソフトで作り続けるんだろう」
「インボイス制度が始まってから、この書き方で合っているのか自信がない」
「請求書サービスと会計ソフトは、同じ会社でそろえた方がいいの？」

先に前提を整理します。当サイトで言うマイクロ法人とは、個人事業を続けながら、役員が自分ひとりだけの小さな会社を別に持ち、役員報酬を低く設定して社会保険料を抑える運用を指します。仕組みの全体像はマイクロ法人の社会保険料削減スキーム完全ガイドで解説しています。

この運用では、請求書の発行元が「個人事業」と「法人」の二つになります。どちらの名義の請求か混ざると、期末に売上を振り分けられず記帳のやり直しになります。請求書サービス選びは売上の記録をどこに集約するかという設計だと考えてください。

この記事では、次の4点を整理します。

• 請求書作成サービス選びの3つの判断軸
• Misoca・マネーフォワード クラウド請求書・freee請求書の比較
• インボイス制度と電子帳簿保存法から見た確認ポイント
• 個人事業主・マイクロ法人・人を雇っている人のタイプ別おすすめ

なお本記事に金額は書いていません。料金は改定されるため、数字を載せた記事はすぐ古くなるからです。最新の料金と機能は各社の公式サイトでご確認ください。ここでは「どういう人に向くか」で比べます。

請求書作成サービス選びの3つの判断軸

① 「作る」までか、「回収」まで見たいか

請求書まわりの仕事は、書類を作る、相手に届ける、入金を確認して消し込む、の三段階に分かれます。

取引先が数社で毎月ほぼ同じ金額なら、作って送るところまでで十分です。十数社を超えて金額もばらつくと、どの請求が入金済みでどれが未入金か、頭の中で管理しきれなくなります。ここから先は入金消込まで見てくれる仕組みの価値が上がります。自分がどこで困っているかを先に決めてください。

② 会計ソフトとどこまでつなげたいか

請求書を作ると、同じ内容を会計ソフトにも売上として記録します。手入力のままだと同じ数字を二回打つことになり、打ち間違いも起きます。

請求書サービスと会計ソフトを同じ提供元でそろえると、この二度手間を減らしやすくなります。会計ソフトを変えたくないなら、それと相性のよい請求書サービスを選ぶのが自然な順序です。売上を帳簿に載せる基本は売上の記帳で整理しています。

③ 発行した請求書をどう保存するか

紙に印刷して郵送した請求書と、データのまま送った請求書とでは保存の考え方が変わります。電子データでやり取りしたものは、電子データのまま保存するのが原則です。

サービス内に発行履歴が残る形なら、自分でフォルダ管理をする手間が減ります。ただし保存の要件を満たすかは、サービス側の説明を読んで自分で確認するのが安全です。詳しくは電子帳簿保存法への対応を参照してください。

主要サービスの比較

比較の観点	Misoca	マネーフォワード クラウド請求書	freee請求書
立ち位置	請求書づくりに絞った単機能型	会計・給与と同じ製品群の一部	会計を中心に据えた製品群の一部
想定される使い方	毎月の請求を手早く作る	請求から入金確認までを一本化	会計側の流れに沿ってまとめる
会計ソフトとの相性	同じ提供元の申告ソフトと組む形	同じ提供元の会計と組む形	同じ提供元の会計と組む形
簿記の知識	ほぼ不要	あると理解が早い	不要な前提で作られた画面
確認したい点	請求以外の機能は別途必要	使う機能の範囲を先に決めたい	会計側と考え方をそろえたい
こんな人向き	請求書だけ楽にしたい個人事業主	個人と法人の二刀流で数字を集約したい人	経理全体を一つの流れで組みたい人

表の記述は当たりをつけるためのものです。実際の機能の有無は各社の公式サイトで確認し、無料で試せる期間に自分の請求書を一枚作ってみてください。それだけで、合うかどうかはだいたい分かります。

主要3サービスの特徴

Misoca

強みは、やることが請求書まわりに絞られている点です。画面の項目が少ないので、初めての人でも迷いにくい構成になっています。見積書から請求書へ、といった書類のつながりも扱いやすい部類です。

向いている人は、会計ソフトは決まっていて請求書づくりだけを楽にしたい個人事業主です。毎月同じ相手に同じ金額を請求する方は、ひな形にできる点が効いてきます。

注意点は、請求以外の仕事には別の道具が要ることです。経費精算や給与までまとめたいなら、製品群でそろう選択肢のほうが収まります。

マネーフォワード クラウド請求書

強みは、会計・経費・給与と同じ土台の上にある点です。発行したあと入金があったかを同じ並びで追いやすく、売掛金の残りが見えやすいのが利点です。

向いている人は、個人事業と法人の両方を回している方です。帳簿が二つあると売上の区別がつかなくなりやすいため、記録の置き場所をそろえる効果が大きくなります。

注意点は、機能が多い分、使う範囲を決めないと画面に圧倒されることです。まずは請求書と会計だけ、と区切って始めるのがおすすめです。会計側の選び方はマイクロ法人の会計ソフトはどれ？freee・MF・弥生の選び方で書いています。

freee請求書

強みは、簿記の知識がなくても進められるように画面が設計されている点です。会計側と考え方が一本でつながっているため、請求書を出したあとの処理で迷いにくくなります。

向いている人は、これから経理の仕組みを一から作る方です。すでに複雑な運用がある人より、白紙から組む人のほうが恩恵を受けやすい性格があります。

注意点は、独自の考え方に沿って操作する場面があることです。簿記を学んだ方だと回りくどく感じることもあります。好みの差が大きいので、試用期間に触って判断してください。

タイプ別のおすすめ

個人事業主で取引先が少ない場合

請求が月に数枚なら、作って送るところまでで十分です。単機能型で手早く始め、件数が増えてから乗り換えを考えるので間に合います。消費税の登録の有無で書き方が変わる点だけ先に押さえてください。詳しくは個人事業主のインボイス制度対応にまとめています。

マイクロ法人と個人事業の二刀流の場合

発行元が二つあるので、請求書の番号の付け方を最初に分けておくと後が楽です。法人側は法人名義、個人事業側は屋号という具合に、見ただけで区別できる形にしてください。法人側の登録はマイクロ法人は消費税・インボイス登録すべき？で検討しています。

人を雇っている・請求件数が多い場合

誰が発行した請求か、誰が入金を確認したかという分担が出てきます。この段階では、書類を作る機能より入金消込と履歴の残り方が中心になります。給与や経費精算も同時に要るため、製品群でそろえる判断が現実的です。

インボイス制度・電子帳簿保存法で確認しておきたいこと

請求書まわりには「発行する側」と「受け取る側」の二つの仕事があり、求められることが違います。

発行する側は、載せる項目がそろっているかという話です。登録番号、取引の年月日、内容、税率ごとに区分した金額、消費税額、相手の名称といった要素が求められます。ひな形にこれらの入力欄があるかを、自分の目で確かめてください。

受け取る側は、届いた請求書をどう保存し、相手の登録番号をどう確かめるかという話です。手順は受け取ったインボイスの確認で整理しています。発行と受領は別の作業なので、片方だけ整えて安心しないでください。

導入前に確認しておきたい4つのこと

• 乗り換える時期：期の途中で変えると前半と後半で様式が変わります。期首から切り替えるのが無難です。
• 過去の請求書の扱い：データを持ち込めるとは限りません。取引先の一覧だけでも移せるか確認しましょう。
• 送付の手段：データで送るのか郵送を代行してもらうのかで、必要な機能が変わります。
• 困ったときの相談先：問い合わせ手段と返答までの時間は、使い始めてから効いてきます。

地味ですが効くのが請求書の見た目です。取引先が経理担当を通す会社だと、様式が整っていないと差し戻しが起きます。一度印刷して確かめてください。

よくある質問（FAQ）

Q. 表計算ソフトで作った請求書ではいけないのですか？

A. 記載事項がそろっていれば様式に決まりはありません。起きやすいのは番号の重複や控えの保存漏れです。月に十枚を超えると管理の手間が効いてきます。

Q. 会計ソフトと同じ会社でそろえるべきですか？

A. そろえたほうが二度打ちを減らしやすいのは確かです。ただし使い慣れた会計ソフトがあるなら、そちらを軸に請求書側を選ぶ順序でかまいません。決め手は提供元の統一ではありません。

Q. 個人事業と法人で、請求書サービスは分けるべきですか？

A. 契約を分けるかより、どちらの名義の売上か一目で分かる状態を作れているかが重要です。一つのサービス内で事業者を分けて管理できるなら、それでも支障はありません。

Q. 途中で別のサービスに乗り換えられますか？

A. 可能ですが、過去の請求データがそのまま移るとは限りません。期首に合わせて切り替え、古いほうは保存期間が終わるまで参照できる状態にしておくのが安全です。

Q. 請求書サービスを入れれば税理士は不要になりますか？

A. 役割が違います。請求書サービスは書類を作って記録する道具で、税務の判断まではしてくれません。判断が要る場面を切り分けて依頼範囲を決めると、費用を抑えやすくなります。

まとめ

• 「作る・届ける・回収する」のどこで困っているかを先に決めると、候補が絞れます。
• 売上の数字が一か所に集まる形を作れるかが、提供元の統一より優先される判断軸です。
• 発行側と受領側は別の仕事です。片方を整えただけで安心しないでください。
• 乗り換えるなら期首が無難で、過去データの扱いは事前に確認しておきます。
• 料金と機能は改定されます。最後は各社の公式サイトの情報で判断してください。

試用期間のうちに一枚作って、送る側と受け取る側の両方の目で眺めてみてください。

※本記事は2026年9月時点の情報をもとにしています。サービスの料金・機能は変更されることがあります。実際の判断は、各社の公式サイトおよび顧問税理士にご確認のうえご自身の責任でお進めください。